衛生福利部(前行政院衛生署) 於2002年依據修正公布之「人體器官移植條例」於同年6月6日正式捐助成立「財團法人器官捐贈移植登錄中心」，期許成為捐贈者、受贈者、器官勸募醫院及器官移植醫院彼此間的溝通平台，並協助政府從事器官捐贈與移植之登錄、資料庫建立與器官捐贈推廣工作，致力於提升國人器官捐贈勸募率及器官移植成功率。

有鑑於此，本中心邀集國內移植相關專家及醫院，參考歐美做法，共同訂定我國各項器官分配原則，並建置「器官捐贈移植登錄系統」，於2005年4月1日正式啟用線上配對與分配機制，減少人為干預，以建立公平公正的器官分配制度；並針對臨床醫事人員辦理教育訓練課程及建立認證制度，增進其對器官捐贈的專業知能；此外，亦積極推廣生命教育與大眾宣導，透過媒體與各樣活動，對校園、企業、醫院及社會大眾普及器官捐贈的觀念，肯定器官捐贈對社會的貢獻，並對於大愛捐贈器官的捐贈者家屬們提供關懷服務，協助早日走出悲傷，肯定捐贈的意義。

由於台灣已邁入高齡化社會，老年與末期照護成為重要議題，能平安地走完人生最後一段路是大家重要的思考。本中心在2020年新增安寧緩和及病人自主業務，並更名為「財團法人器官捐贈移植登錄及病人自主推廣中心」，以提供友善的生命善終照護環境為目標；鼓勵民眾提前思考臨終的各種選項，並在步上生命終點的同時，留下可用的器官遺愛人間。透過預立醫療決定、安寧緩和醫療及器官捐贈意願的推廣，讓大家對於生命末期有更深入的思考，也為建構自主醫療及末期照護的網絡共同努力。

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